MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 44337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013740	CAG	2	6	159855	159860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047520
3002	NC_013740	TGA	2	6	159907	159912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047520
3003	NC_013740	TGG	3	9	160018	160026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047520
3004	NC_013740	AGCC	2	8	160029	160036	25 %	0 %	25 %	50 %	284047520
3005	NC_013740	GCA	2	6	160054	160059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047520
3006	NC_013740	TCCGG	2	10	160195	160204	0 %	20 %	40 %	40 %	284047520
3007	NC_013740	TCCC	2	8	160247	160254	0 %	25 %	0 %	75 %	284047520
3008	NC_013740	AAAT	2	8	160270	160277	75 %	25 %	0 %	0 %	284047520
3009	NC_013740	ATG	2	6	160476	160481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047521
3010	NC_013740	ATC	2	6	160485	160490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047521
3011	NC_013740	TGG	2	6	160561	160566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047521
3012	NC_013740	CGGC	2	8	160586	160593	0 %	0 %	50 %	50 %	284047521
3013	NC_013740	CGG	2	6	160700	160705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047521
3014	NC_013740	AAG	2	6	160729	160734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047521
3015	NC_013740	GAG	2	6	160749	160754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047521
3016	NC_013740	CGC	2	6	160789	160794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047521
3017	NC_013740	GTG	2	6	160800	160805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047521
3018	NC_013740	CCGG	2	8	160822	160829	0 %	0 %	50 %	50 %	284047521
3019	NC_013740	G	7	7	160844	160850	0 %	0 %	100 %	0 %	284047521
3020	NC_013740	GAAG	2	8	160853	160860	50 %	0 %	50 %	0 %	284047521
3021	NC_013740	TGC	2	6	160893	160898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047521
3022	NC_013740	TGC	2	6	160945	160950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047521
3023	NC_013740	CCA	2	6	160999	161004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047521
3024	NC_013740	ACC	2	6	161025	161030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047521
3025	NC_013740	TGA	2	6	161068	161073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047521
3026	NC_013740	CCA	2	6	161086	161091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047521
3027	NC_013740	GCT	2	6	161099	161104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047521
3028	NC_013740	GAA	2	6	161151	161156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047521
3029	NC_013740	GGC	2	6	161216	161221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047521
3030	NC_013740	GCCAG	2	10	161285	161294	20 %	0 %	40 %	40 %	284047522
3031	NC_013740	CGGCTC	2	12	161308	161319	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284047522
3032	NC_013740	GAA	2	6	161355	161360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047522
3033	NC_013740	CCGGA	2	10	161390	161399	20 %	0 %	40 %	40 %	284047522
3034	NC_013740	ATC	2	6	161407	161412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047522
3035	NC_013740	GGACG	2	10	161475	161484	20 %	0 %	60 %	20 %	284047522
3036	NC_013740	CGC	2	6	161790	161795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047522
3037	NC_013740	CGG	2	6	161805	161810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047522
3038	NC_013740	TCA	2	6	161843	161848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047522
3039	NC_013740	GCG	2	6	161906	161911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047522
3040	NC_013740	TGG	2	6	161912	161917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047522
3041	NC_013740	GCA	2	6	161929	161934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047522
3042	NC_013740	CTG	2	6	161947	161952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047522
3043	NC_013740	A	7	7	161956	161962	100 %	0 %	0 %	0 %	284047522
3044	NC_013740	CCG	2	6	161964	161969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047522
3045	NC_013740	CAT	2	6	162021	162026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047522
3046	NC_013740	G	6	6	162060	162065	0 %	0 %	100 %	0 %	284047522
3047	NC_013740	GCG	2	6	162070	162075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047522
3048	NC_013740	GCC	2	6	162091	162096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047522
3049	NC_013740	GGGC	2	8	162141	162148	0 %	0 %	75 %	25 %	284047522
3050	NC_013740	CCAT	2	8	162194	162201	25 %	25 %	0 %	50 %	284047522
3051	NC_013740	CTG	2	6	162235	162240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047522
3052	NC_013740	CGG	3	9	162258	162266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047522
3053	NC_013740	GTG	2	6	162325	162330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047522
3054	NC_013740	CTG	2	6	162352	162357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047522
3055	NC_013740	GGC	2	6	162401	162406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047522
3056	NC_013740	TGC	2	6	162432	162437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047522
3057	NC_013740	GGC	2	6	162453	162458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047522
3058	NC_013740	CAC	2	6	162513	162518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047522
3059	NC_013740	CTG	2	6	162535	162540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047522
3060	NC_013740	AGG	2	6	162609	162614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047522
3061	NC_013740	CCTGG	2	10	162657	162666	0 %	20 %	40 %	40 %	284047523
3062	NC_013740	GGC	2	6	162667	162672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047523
3063	NC_013740	GGA	2	6	162677	162682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047523
3064	NC_013740	CGG	2	6	162690	162695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047523
3065	NC_013740	GGC	2	6	162704	162709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047523
3066	NC_013740	GCC	2	6	162765	162770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047523
3067	NC_013740	CGG	2	6	162798	162803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047523
3068	NC_013740	GGC	2	6	162847	162852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047523
3069	NC_013740	GGA	2	6	162860	162865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047523
3070	NC_013740	GCC	2	6	162912	162917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047523
3071	NC_013740	CCGGA	2	10	162933	162942	20 %	0 %	40 %	40 %	284047523
3072	NC_013740	GGA	2	6	162971	162976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047523
3073	NC_013740	ATCCCC	2	12	163042	163053	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	284047523
3074	NC_013740	GAA	2	6	163068	163073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047523
3075	NC_013740	CGGTA	2	10	163104	163113	20 %	20 %	40 %	20 %	284047523
3076	NC_013740	GCCA	2	8	163134	163141	25 %	0 %	25 %	50 %	284047523
3077	NC_013740	GT	3	6	163204	163209	0 %	50 %	50 %	0 %	284047523
3078	NC_013740	GGC	2	6	163229	163234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047523
3079	NC_013740	GAT	2	6	163263	163268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047523
3080	NC_013740	GGACC	2	10	163269	163278	20 %	0 %	40 %	40 %	284047523
3081	NC_013740	GGCC	2	8	163370	163377	0 %	0 %	50 %	50 %	284047523
3082	NC_013740	CCGG	2	8	163391	163398	0 %	0 %	50 %	50 %	284047523
3083	NC_013740	GAA	2	6	163407	163412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047523
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3085	NC_013740	CGG	2	6	163564	163569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047523
3086	NC_013740	CGG	2	6	163572	163577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047523
3087	NC_013740	GAA	2	6	163640	163645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047523
3088	NC_013740	GTTCCG	2	12	163646	163657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047523
3089	NC_013740	GGT	2	6	163658	163663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047523
3090	NC_013740	TATGA	2	10	163727	163736	40 %	40 %	20 %	0 %	284047524
3091	NC_013740	GTG	2	6	163868	163873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047524
3092	NC_013740	GGCA	2	8	163936	163943	25 %	0 %	50 %	25 %	284047524
3093	NC_013740	TCCGG	2	10	164101	164110	0 %	20 %	40 %	40 %	284047524
3094	NC_013740	ATC	2	6	164120	164125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047524
3095	NC_013740	AGC	2	6	164166	164171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047524
3096	NC_013740	GCC	2	6	164216	164221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047524
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3098	NC_013740	CTG	2	6	164327	164332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047524
3099	NC_013740	GCC	2	6	164378	164383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047524
3100	NC_013740	GCC	2	6	164426	164431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047524
3101	NC_013740	GAA	3	9	164471	164479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047524
3102	NC_013740	TCA	2	6	164556	164561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047524
3103	NC_013740	GCT	2	6	164575	164580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047524
3104	NC_013740	GGC	2	6	164659	164664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047524
3105	NC_013740	ATG	2	6	164721	164726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047524
3106	NC_013740	CAT	2	6	164797	164802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047524
3107	NC_013740	GTG	2	6	164816	164821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047524
3108	NC_013740	ATACCC	2	12	164887	164898	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	284047525
3109	NC_013740	ATT	2	6	164905	164910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047525
3110	NC_013740	GCT	2	6	164943	164948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047525
3111	NC_013740	ATC	2	6	164973	164978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047525
3112	NC_013740	CCA	2	6	165007	165012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047525
3113	NC_013740	CGA	2	6	165038	165043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047525
3114	NC_013740	CAC	2	6	165212	165217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047525
3115	NC_013740	ATG	2	6	165220	165225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047525
3116	NC_013740	GGA	2	6	165260	165265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047525
3117	NC_013740	TCCG	2	8	165267	165274	0 %	25 %	25 %	50 %	284047525
3118	NC_013740	GCT	2	6	165401	165406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047525
3119	NC_013740	G	6	6	165506	165511	0 %	0 %	100 %	0 %	284047525
3120	NC_013740	CGA	2	6	165590	165595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047525
3121	NC_013740	TAC	2	6	165615	165620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047525
3122	NC_013740	GGGA	2	8	165842	165849	25 %	0 %	75 %	0 %	284047526
3123	NC_013740	TGA	2	6	165877	165882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047526
3124	NC_013740	CGG	2	6	165979	165984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047526
3125	NC_013740	GCG	2	6	166011	166016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047526
3126	NC_013740	CGGGG	2	10	166056	166065	0 %	0 %	80 %	20 %	284047526
3127	NC_013740	ATC	2	6	166134	166139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047526
3128	NC_013740	CGG	2	6	166150	166155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047526
3129	NC_013740	GCG	2	6	166209	166214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047526
3130	NC_013740	GCCCG	2	10	166218	166227	0 %	0 %	40 %	60 %	284047526
3131	NC_013740	GAA	2	6	166257	166262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047526
3132	NC_013740	GTGG	2	8	166292	166299	0 %	25 %	75 %	0 %	284047526
3133	NC_013740	AG	3	6	166405	166410	50 %	0 %	50 %	0 %	284047526
3134	NC_013740	CAT	2	6	166520	166525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047527
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3140	NC_013740	GCC	2	6	166802	166807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047527
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3143	NC_013740	GAA	2	6	166900	166905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047527
3144	NC_013740	CTG	2	6	166955	166960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047527
3145	NC_013740	CTG	2	6	166970	166975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047527
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3155	NC_013740	TGC	2	6	167268	167273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047528
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3157	NC_013740	CGGA	2	8	167327	167334	25 %	0 %	50 %	25 %	284047528
3158	NC_013740	TGC	2	6	167340	167345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047528
3159	NC_013740	CGGC	2	8	167419	167426	0 %	0 %	50 %	50 %	284047528
3160	NC_013740	G	7	7	167462	167468	0 %	0 %	100 %	0 %	284047528
3161	NC_013740	TCA	2	6	167547	167552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047528
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3164	NC_013740	GAACA	2	10	167591	167600	60 %	0 %	20 %	20 %	284047528
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3222	NC_013740	ACCT	2	8	170904	170911	25 %	25 %	0 %	50 %	284047532
3223	NC_013740	T	8	8	170935	170942	0 %	100 %	0 %	0 %	284047532
3224	NC_013740	GGC	2	6	171017	171022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047532
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3227	NC_013740	CAGCA	2	10	171125	171134	40 %	0 %	20 %	40 %	284047532
3228	NC_013740	T	6	6	171149	171154	0 %	100 %	0 %	0 %	284047532
3229	NC_013740	AT	3	6	171183	171188	50 %	50 %	0 %	0 %	284047532
3230	NC_013740	CTC	2	6	171284	171289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047532
3231	NC_013740	T	6	6	171688	171693	0 %	100 %	0 %	0 %	284047533
3232	NC_013740	GAA	2	6	171709	171714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047533
3233	NC_013740	GCC	2	6	171832	171837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047533
3234	NC_013740	GCCAGG	2	12	171842	171853	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284047533
3235	NC_013740	GTG	2	6	171866	171871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047533
3236	NC_013740	CCA	2	6	171918	171923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047533
3237	NC_013740	CAG	2	6	171925	171930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047533
3238	NC_013740	CAG	2	6	171970	171975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047533
3239	NC_013740	GGGC	2	8	172041	172048	0 %	0 %	75 %	25 %	284047533
3240	NC_013740	CAG	2	6	172078	172083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047533
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3242	NC_013740	CCA	2	6	172152	172157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047533
3243	NC_013740	CAG	2	6	172174	172179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047533
3244	NC_013740	GCC	2	6	172258	172263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047533
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3364	NC_013740	C	6	6	177664	177669	0 %	0 %	0 %	100 %	284047538
3365	NC_013740	TGG	2	6	177760	177765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047538
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3463	NC_013740	GGGCAT	2	12	182557	182568	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284047542
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3477	NC_013740	TCC	3	9	183812	183820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047544
3478	NC_013740	GTTG	2	8	183855	183862	0 %	50 %	50 %	0 %	284047544
3479	NC_013740	TGG	3	9	183888	183896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047544
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3481	NC_013740	CGG	2	6	183933	183938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047544
3482	NC_013740	GTCC	2	8	183958	183965	0 %	25 %	25 %	50 %	284047544
3483	NC_013740	GCT	2	6	183993	183998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047544
3484	NC_013740	T	6	6	184046	184051	0 %	100 %	0 %	0 %	284047544
3485	NC_013740	CAG	2	6	184117	184122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047544
3486	NC_013740	GCT	2	6	184169	184174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047544
3487	NC_013740	AACAGG	2	12	184313	184324	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284047544
3488	NC_013740	TCT	2	6	184365	184370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047544
3489	NC_013740	CGC	2	6	184423	184428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047544
3490	NC_013740	G	6	6	184449	184454	0 %	0 %	100 %	0 %	284047544
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